La Biochimie

26.05.2013

La Biochimie, c'est quoi ? (UE1)

Selon Wikipédia : "La biochimie est la discipline scientifique qui étudie les réactions chimiques ayant lieu au sein du vivant et par conséquent, au sein des cellules. Elle se divise en deux groupes : la biochimie statique (étudie la composition et les propriétés physico-chimiques) et la biochimie dynamique (étudie les transformations et les réactions chimiques)"

Bah, de toute façon, c'est dur à définir une matière, non ?

I) Introduction :

La vraie appellation de cette matière est : Atomes, Biomolécules, génome, bioénergétique, Métabolisme. Un peu long hein ? Ouais vous avez raison. Bioch' c'est bien mieux.

Comme nous l'avons vu précédemment, la Bioch représente 100 points sur 640 et 10 ECTS sut 60. Sachant que vous avez en tout 12 matières (ou 11 si on regroupe la physique des deux semestres), nous pouvons affirmer que c'est une des matières les plus importantes de l'année.

Vous aurez quelques calculs à faire dans cette matière, mais rien de bien compliqué au niveau mathématiques. Là où vous allez vous arracher les cheveux, c'est quand vous devrez apprendre la structure de chaque molécule... Eh ouais. Les glucides, les lipides, les acides aminés, tout ça c'est à connaître ! Tout ça, entre autres, naturellement, le programme ne s'arrête pas là.

En parlant de programme ?

II) Le Programme :

L’atome :

- Classification périodique des éléments
- Représentation et configuration électronique
- Structure du noyau atomique
- Liaisons entre atomes et notions d’isomérie :
♥ Liaisons et orbitales moléculaires
♥ Liaisons non covalentes
♥ Liaisons covalentes
♥ Effets inductifs, résonance et mésomérie
♥ Stéréochimie

Thermodynamique :

- Equilibre de dissociation (deuxième principe, enthalpie, potentiel chimique)

Description des fonctions chimiques simples :

- Chaînes hydrocarbonées
- Fonctions hydroxyles et dérivés
- Fonctions amines et dérivés
- Fonctions aldéhydes ou cétones
- Fonctions acides carboxyliques et dérivés

Principales réactions entre fonctions chimiques en biologie :

- Réactions acide-base
- Réactions d’oxydoréduction
- Description des principaux mécanismes réactionnels : substitution, addition, élimination
- Exemples de réactions de fonctions chimiques des molécules biologiques : alcools, amines, thiols, aldéhydes et cétones, carboxyles

Structure, diversité et fonction des biomolécules :

- Acides aminés et dérivés :
♥ Structure et propriétés des AA
♥ Propriétés et rôle biologique des dérivés d’acides aminés
♥ Méthodes d’étude

- Peptides et protéines :
♥ Structure primaire et liaison peptidique
♥ Structures secondaires, tertiaire et quaternaire des protéines
♥ Propriétés et méthodes d’étude des protéines
♥ Relation structure-fonction

- Enzymes :
♥ Pouvoir catalytique et cinétique des enzymes
♥ Régulation de l’activité des enzymes
♥ Les iso enzymes et leur intérêt en biologie
♥ Mesure de l’activité des enzymes
♥ Coenzymes et vitamines

- Glucides :
  ♥ Oses simples ou monosaccharides
  ♥ Oses complexes ou polysaccharides
  ♥ Glycoprotéines et glycolipides
  ♥ Un exemple de voie métabolique des oses : la glycolyse

- Lipides :
  ♥ Acides gras et dérivés : structure, rôle biologique
  ♥ Glycérides
  ♥ Stérols et stéroïdes
  ♥ Lipoprotéines et rôle biologique

Organisation, évolution et fonction du génome humain :

- Structure et métabolisme des nucléotides
- Structure des acides nucléiques
- Chromatine et A.D.N.
- Réplication de l’A.D.N. et mécanismes de réparation
- Mutabilité et dynamique de l’A.D.N.
- Structure et diversité du génome (allèle et polymorphisme)
- Lésions et remaniements du génome
- Transcription et maturation des A.R.N.m
- Régulation de l’expression des gènes
- Code génétique et traduction

Bioénergétique :
♥ Énergétique cellulaire et notions de bioénergétique
♥ Fonction biochimique et rôle des nucléotides riches en énergie

Vue d’ensemble du métabolisme :
  ♥ Principales voies et stratégies du métabolisme énergétique
  ♥ Les oxydations phosphorylantes et le cycle de Krebs
  ♥ Digestion des glucides et glycolyse
  ♥ Néoglucogenèse et métabolisme du glycogène
  ♥ Digestion et transport des lipides
  ♥ βoxydation des acides gras
  ♥ Biosynthèse des acides gras et cétogénèse
  ♥ Métabolisme général des acides aminés et cycle de l’urée

III) Tu veux t'avancer ?

Bon alors moi, je te conseille fortement de prendre des VRAIS VACANCES avant de te lancer dans cette aventure plutôt désagréable... Ou à la limite de réviser tes chapitres de terminale et première et de laisser le programme de PACES pour quand tu seras en PACES.
Mais je sais que toi, futur bizuth derrière ton écran, tu penses qu'il vaut mieux commencer les cours pendant que tu as encoire un peu de temps pour ne pas prendre trop de retard à la rentrée. C'est tout à ton honneur, mais je ne suis pas sûre que ça soit une bonne idée... SOIT ! Il vaut mieux apprendre par soi-même.

Si tu veux réviser tes cours du lycée, tu peux oublier l'anglais, l'histoire-géo, la philo, le français, le sport, l'espagnol, l'allemand ou je ne sais quelle matière... Tu dois te concentrer sur les maths, la physique-chimie, et la biologie ! (attention, la géologie ne te sert à rien non plus)
Vu que ce chapitre concerne la chimie, et vu que je me souviens à peu près de ce que j'ai fait au lycée (même si il y a eu une réforme entre temps, ça n'a pas du beaucoup changer...) voici les chapitres que tu peux revoir :
- Chimie organique, avec la représentation de Lewis qui prend en compte les électrons de valence et tout le blabla, et avec les familles de fonctions (oui les machins incompréhensibles qui te donnaient des 2-bromo-3,6-diméthylnonane ou des trucs dans le genre)
- Réactions acido-basiques et d'oxydo-réduction.
- Attention, ça c'est peut être plus en Bio que tu l'as vu : Tout ce qui concerne l'ADN, les nucléotides, la transcription, la traduction... etc, tu dois tout connaître par coeur. Et révise ta méïose pendant que tu y es !
Si tu considères que tu connais déjà par tes cours de première et terminale, tu peux t'avancer en apprenant ça :
- Les 4 premières périodes du tableau périodique des éléments (de l'Hydrogène au Krypton), tu dois savoir à quelle famille ils appartiennent (alcalins, gaz rares.. etc), à quelle périodes ils se trouvent (la ligne), combien d'électrons ils ont (leur numéro atomique) et... Pour le moment ça suffira.
- Les 20 Acides Aminés classiques (A, R, D, N, C, E, Q, G, H, I, L, K, M, F, P, S, T, W, Y, V). Tu dois connaître leur nom (Ex : Alanine), leur code trois lettres (Ex : Ala), leur abréviation 1 lettre (Ex : A) et leur structure (Ex : C3H7NO2) ce qui donnerait en fait :

Désolée, l'image est tirée d'une vidéo de mes cours, d'où la piètre qualitée.

IV) Les moyens mnémotechniques :

Pour le tableau périodique des éléments :
- 1° période : Pas compliqué y'a que l'hydrogène et l'hélium.
- 2° période : Lily Beche Bien Chez Notre Oncle Ferdinand Nestor.
- 3° période : Napoléon Mange Allégrement Six Poissons Sans se Claquer d'Articulations.
- 4° période : Kevin Cale son Scrotum Titanesque dans le Vagin Crasseux de Monique Fievreuse.
La dernière phrase ne couvre que la moitié de la 4° période. Pour l'autre moitié, je vous conseille de faire votre propre phrase.

Il existe des moyens mnémotechniques pour retenir les Acides Aminés (AA) également, mais ça nécessite de connaître leurs différentes familles... Si vous les voulez, vous pouvez toujours m'envoyer un mail ou laisser un commentaire. Mais vu que cet article est destiné à des futurs bizuths, ça ne sert à rien que je les mette ici, ça ne serait pas approprié.

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J'ai mis un trait parce que c'est la fin de l'article. Haha.